Основными отличиями Т-90 от Т-72Б являются введение комплекса оптико-электронного подавления ТШУ-1 "Штора", комплекса управления огнем 1А45, заимствованного у танка Т-80У, аппаратуры дистанционного подрыва осколочно - фугасного снаряда со специальным взрывателем в заданной точке траектории полета, зенитно-пулеметной установки с дистанционным управлением (по типу установленной на Т-64А), бортовых экранов со встроенной динамической защитой.

 Комплекс ТШУ-1 обеспечивает дополнительную защиту танка путем создания помех в оптическом диапазоне линиям управления ПТУР (снарядов, авиабомб, авиационных УР), имеющих оптическую обратную связь, либо с лазерным наведением (подсветкой). На башне танка Т-90 установлены 12 гранатометов для постановки аэрозольных завес.

 Комплекс управления огнем 1А45 позволяет наводчику и командиру вести прицельную стрельбу артиллерийскими выстрелами из пушки днем и ночью с места и в движении, управляемыми ракетами - с места. В состав комплекса входят система управления огнем 1А42, комплекс управляемого вооружения 9К119 «Рефлекс», приборно-наблюдательный комплекс командира ПНК-4С и тепловизионный танковый комплекс ТО1-ПО2Т.

 Устройство встроенного контроля выверки смонтировано в головке прицела 1Г46 наводчика. Поле зрения прицела cтабилизировано в двух плоскостях. Баллистический вычислитель электронный, цифровой, в нем впервые применен емкостной датчик ветра.

 В боекомплект пушки танка Т-90 введен осколочно-фугасный снаряд с электронным дистанционным взрывателем. Для подготовки взрывателя к работе в режиме дистанционного подрыва используется установщик временных интервалов.

 Встроенная динамическая защита танка Т-90 включает восемь секций на верхнем лобовом листе корпуса, семь блоков и один контейнер на лобовой части башни и двадцать контейнеров на крыше башни. Вдоль бортов корпуса устанавливается по три съемных экрана со встроенной динамической защитой.

 На танке установлен двигатель В-84МС, отличающийся конструкцией выпускных коллекторов.

 Подвеска состоит из шести больших, обрезиненных опорных катков, ведущих звезд и поддерживающих гусеницу роликов.

 Для такого класса машин Т-90С весит необычайно мало: 46,5 тонны. Он гораздо легче французского Leclerc, немецкого Leopard-2 (на 8 тонн), американского M1A1 Abrams (на 11 тонн) и английского Challenger (на 16 тонн). Из них Т-90С — самый низкий танк, что сильно увеличивает выживаемость на поле боя. Т90-С способен отражать одновременное применение противником двух противотанковых ракет с различными принципами наведения на цель, пущенных с разных направлений.